Le pouvoir est tombé dans le déclin après l’assassinat d’Ashikaga Yoshinobu, sixième shogun, en 1441. Les seigneurs féodaux puissants ont commencé à se quereller et leur dispute s’est crystalisée dans la guerre d’Onin de 1467 à 1477. Cette guerre s’est même déroulée à Kyoto, détruite, ce qui a d’autant plus fait perdre au shogunat son prestige. Les seigneurs locaux se sont émancipés, guerroyaient contre leurs voisins et accroissaient leurs domaines jusqu’à obtenir de vastes zones sous leurs autorités.

Oda Nobunaga (1534-1582) était l’héritier légitime d’un seigneur du sud ouest d’Owari (ouest du département d’Aichi) et a entrepris de réunifier le pays. Il a d’abord assis son autorité en terrassant Imakawa Yoshimoto de Suruga (département de Shizuoka), grand seigneur très influent de l’époque, alors que ce dernier marchait militairement sur Kyoto. Il a ensuite étendu son fief à Inuyama en éliminant Oda Nobukiyo, seigneur local puis a conclu une alliance avec Tokugawa Ieyasu, de Mikawa (est du département d’Aichi). Il a éliminé le clan Saito et a fait de leur ancien fief Mino (département de Gifu) son lieu de résidence. Il a marché sur Kyoto avec le shogun Ashikaga Yoshiaki pour restaurer son autorité perdue. Mais alors que ce dernier a voulu par la suite s’émanciper, Oda Nobunaga l’a expulsé de la province de Kinai après avoir découvert son complot avec d’autres seigneurs.